Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

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Length 392 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Sh3bp5lQ99LH9 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3bp5lQ99LH9 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Sh3bp5lQ99LH9 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Sh3bp5lQ99LH9 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3bp5lQ99LH9 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
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Sh3bp5lQ99LH9 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Sh3bp5lQ99LH9 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Sh3bp5lQ99LH9 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Sh3bp5lQ99LH9 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Sh3bp5lQ99LH9 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Sh3bp5lQ99LH9 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Sh3bp5lQ99LH9 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Sh3bp5lQ99LH9 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3bp5lQ99LH9 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Sh3bp5lQ99LH9 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Sh3bp5lQ99LH9 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3bp5lQ99LH9 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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