Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ0

Ubxn2a, UBX domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2aQ99KJ0 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn2aQ99KJ0 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms