Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW4

Lims1, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 1, mousemouse

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Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims1Q99JW4 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lims1Q99JW4 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Lims1Q99JW4 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lims1Q99JW4 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lims1Q99JW4 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Lims1Q99JW4 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Lims1Q99JW4 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Lims1Q99JW4 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Lims1Q99JW4 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Lims1Q99JW4 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lims1Q99JW4 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Lims1Q99JW4 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Lims1Q99JW4 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lims1Q99JW4 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Lims1Q99JW4 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lims1Q99JW4 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lims1Q99JW4 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lims1Q99JW4 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Lims1Q99JW4 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lims1Q99JW4 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lims1Q99JW4 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Lims1Q99JW4 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Lims1Q99JW4 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lims1Q99JW4 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lims1Q99JW4 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lims1Q99JW4 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lims1Q99JW4 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lims1Q99JW4 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lims1Q99JW4 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lims1Q99JW4 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lims1Q99JW4 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Lims1Q99JW4 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lims1Q99JW4 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lims1Q99JW4 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lims1Q99JW4 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lims1Q99JW4 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lims1Q99JW4 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lims1Q99JW4 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lims1Q99JW4 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lims1Q99JW4 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lims1Q99JW4 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lims1Q99JW4 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lims1Q99JW4 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lims1Q99JW4 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lims1Q99JW4 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lims1Q99JW4 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lims1Q99JW4 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lims1Q99JW4 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lims1Q99JW4 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lims1Q99JW4 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lims1Q99JW4 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lims1Q99JW4 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lims1Q99JW4 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Lims1Q99JW4 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Lims1Q99JW4 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Lims1Q99JW4 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lims1Q99JW4 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lims1Q99JW4 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lims1Q99JW4 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Lims1Q99JW4 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Lims1Q99JW4 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lims1Q99JW4 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lims1Q99JW4 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lims1Q99JW4 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lims1Q99JW4 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lims1Q99JW4 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lims1Q99JW4 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lims1Q99JW4 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lims1Q99JW4 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Lims1Q99JW4 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Lims1Q99JW4 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lims1Q99JW4 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lims1Q99JW4 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lims1Q99JW4 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lims1Q99JW4 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lims1Q99JW4 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lims1Q99JW4 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lims1Q99JW4 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lims1Q99JW4 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lims1Q99JW4 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lims1Q99JW4 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lims1Q99JW4 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lims1Q99JW4 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lims1Q99JW4 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lims1Q99JW4 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lims1Q99JW4 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lims1Q99JW4 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lims1Q99JW4 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lims1Q99JW4 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lims1Q99JW4 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lims1Q99JW4 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lims1Q99JW4 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lims1Q99JW4 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lims1Q99JW4 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lims1Q99JW4 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lims1Q99JW4 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lims1Q99JW4 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lims1Q99JW4 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lims1Q99JW4 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lims1Q99JW4 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms