Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD72

Ttc8, Tetratricopeptide repeat protein 8, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc8Q8VD72 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttc8Q8VD72 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttc8Q8VD72 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttc8Q8VD72 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttc8Q8VD72 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttc8Q8VD72 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttc8Q8VD72 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttc8Q8VD72 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttc8Q8VD72 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttc8Q8VD72 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttc8Q8VD72 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttc8Q8VD72 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttc8Q8VD72 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttc8Q8VD72 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttc8Q8VD72 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttc8Q8VD72 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttc8Q8VD72 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttc8Q8VD72 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttc8Q8VD72 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttc8Q8VD72 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttc8Q8VD72 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttc8Q8VD72 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttc8Q8VD72 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttc8Q8VD72 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttc8Q8VD72 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttc8Q8VD72 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ttc8Q8VD72 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ttc8Q8VD72 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ttc8Q8VD72 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ttc8Q8VD72 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ttc8Q8VD72 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ttc8Q8VD72 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ttc8Q8VD72 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ttc8Q8VD72 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ttc8Q8VD72 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ttc8Q8VD72 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ttc8Q8VD72 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ttc8Q8VD72 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ttc8Q8VD72 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ttc8Q8VD72 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ttc8Q8VD72 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ttc8Q8VD72 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ttc8Q8VD72 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ttc8Q8VD72 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ttc8Q8VD72 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ttc8Q8VD72 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ttc8Q8VD72 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ttc8Q8VD72 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ttc8Q8VD72 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ttc8Q8VD72 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ttc8Q8VD72 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ttc8Q8VD72 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ttc8Q8VD72 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ttc8Q8VD72 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ttc8Q8VD72 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ttc8Q8VD72 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ttc8Q8VD72 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ttc8Q8VD72 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ttc8Q8VD72 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ttc8Q8VD72 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ttc8Q8VD72 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ttc8Q8VD72 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ttc8Q8VD72 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ttc8Q8VD72 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ttc8Q8VD72 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ttc8Q8VD72 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ttc8Q8VD72 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ttc8Q8VD72 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ttc8Q8VD72 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ttc8Q8VD72 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ttc8Q8VD72 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ttc8Q8VD72 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ttc8Q8VD72 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ttc8Q8VD72 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ttc8Q8VD72 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ttc8Q8VD72 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ttc8Q8VD72 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ttc8Q8VD72 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ttc8Q8VD72 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ttc8Q8VD72 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ttc8Q8VD72 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ttc8Q8VD72 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ttc8Q8VD72 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ttc8Q8VD72 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ttc8Q8VD72 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ttc8Q8VD72 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ttc8Q8VD72 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ttc8Q8VD72 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ttc8Q8VD72 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ttc8Q8VD72 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ttc8Q8VD72 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ttc8Q8VD72 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ttc8Q8VD72 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ttc8Q8VD72 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ttc8Q8VD72 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ttc8Q8VD72 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ttc8Q8VD72 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Ttc8Q8VD72 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ttc8Q8VD72 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ttc8Q8VD72 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms