Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Ubxn4Q8VCH8 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
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