Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC88

Gca, Grancalcin, mousemouse

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Length 220 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GcaQ8VC88 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms