Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Vmn1r200Q8R281 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Vmn1r200Q8R281 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Vmn1r200Q8R281 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Vmn1r200Q8R281 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Vmn1r200Q8R281 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vmn1r200Q8R281 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vmn1r200Q8R281 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vmn1r200Q8R281 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vmn1r200Q8R281 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vmn1r200Q8R281 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vmn1r200Q8R281 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vmn1r200Q8R281 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vmn1r200Q8R281 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vmn1r200Q8R281 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vmn1r200Q8R281 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vmn1r200Q8R281 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Vmn1r200Q8R281 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Vmn1r200Q8R281 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vmn1r200Q8R281 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Vmn1r200Q8R281 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vmn1r200Q8R281 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vmn1r200Q8R281 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vmn1r200Q8R281 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vmn1r200Q8R281 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vmn1r200Q8R281 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Vmn1r200Q8R281 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vmn1r200Q8R281 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vmn1r200Q8R281 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Vmn1r200Q8R281 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vmn1r200Q8R281 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vmn1r200Q8R281 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Vmn1r200Q8R281 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vmn1r200Q8R281 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vmn1r200Q8R281 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vmn1r200Q8R281 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vmn1r200Q8R281 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vmn1r200Q8R281 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Vmn1r200Q8R281 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vmn1r200Q8R281 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vmn1r200Q8R281 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vmn1r200Q8R281 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vmn1r200Q8R281 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vmn1r200Q8R281 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vmn1r200Q8R281 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vmn1r200Q8R281 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vmn1r200Q8R281 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vmn1r200Q8R281 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vmn1r200Q8R281 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vmn1r200Q8R281 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vmn1r200Q8R281 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vmn1r200Q8R281 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vmn1r200Q8R281 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vmn1r200Q8R281 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vmn1r200Q8R281 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vmn1r200Q8R281 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vmn1r200Q8R281 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vmn1r200Q8R281 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vmn1r200Q8R281 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vmn1r200Q8R281 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vmn1r200Q8R281 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vmn1r200Q8R281 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vmn1r200Q8R281 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vmn1r200Q8R281 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vmn1r200Q8R281 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vmn1r200Q8R281 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vmn1r200Q8R281 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Vmn1r200Q8R281 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vmn1r200Q8R281 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vmn1r200Q8R281 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vmn1r200Q8R281 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Vmn1r200Q8R281 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vmn1r200Q8R281 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vmn1r200Q8R281 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vmn1r200Q8R281 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Vmn1r200Q8R281 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vmn1r200Q8R281 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Vmn1r200Q8R281 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vmn1r200Q8R281 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vmn1r200Q8R281 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vmn1r200Q8R281 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vmn1r200Q8R281 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vmn1r200Q8R281 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vmn1r200Q8R281 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vmn1r200Q8R281 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vmn1r200Q8R281 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Vmn1r200Q8R281 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vmn1r200Q8R281 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vmn1r200Q8R281 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vmn1r200Q8R281 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vmn1r200Q8R281 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vmn1r200Q8R281 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vmn1r200Q8R281 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vmn1r200Q8R281 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Vmn1r200Q8R281 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Vmn1r200Q8R281 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Vmn1r200Q8R281 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Vmn1r200Q8R281 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Vmn1r200Q8R281 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Vmn1r200Q8R281 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms