Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZS5

Rnf183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, mousemouse

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Length 190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf183Q8QZS5 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Rnf183Q8QZS5 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Rnf183Q8QZS5 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Rnf183Q8QZS5 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Rnf183Q8QZS5 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Rnf183Q8QZS5 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Rnf183Q8QZS5 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Rnf183Q8QZS5 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
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Rnf183Q8QZS5 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Rnf183Q8QZS5 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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