Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
OptnQ8K3K8 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms