Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5S7

Rec8, Meiotic recombination protein REC8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rec8Q8C5S7 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rec8Q8C5S7 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rec8Q8C5S7 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rec8Q8C5S7 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rec8Q8C5S7 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rec8Q8C5S7 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rec8Q8C5S7 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rec8Q8C5S7 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rec8Q8C5S7 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rec8Q8C5S7 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rec8Q8C5S7 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rec8Q8C5S7 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rec8Q8C5S7 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rec8Q8C5S7 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rec8Q8C5S7 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rec8Q8C5S7 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rec8Q8C5S7 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rec8Q8C5S7 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rec8Q8C5S7 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rec8Q8C5S7 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rec8Q8C5S7 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rec8Q8C5S7 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rec8Q8C5S7 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rec8Q8C5S7 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rec8Q8C5S7 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rec8Q8C5S7 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rec8Q8C5S7 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rec8Q8C5S7 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rec8Q8C5S7 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rec8Q8C5S7 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rec8Q8C5S7 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rec8Q8C5S7 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rec8Q8C5S7 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rec8Q8C5S7 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rec8Q8C5S7 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rec8Q8C5S7 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rec8Q8C5S7 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rec8Q8C5S7 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rec8Q8C5S7 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rec8Q8C5S7 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rec8Q8C5S7 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rec8Q8C5S7 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rec8Q8C5S7 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rec8Q8C5S7 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rec8Q8C5S7 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rec8Q8C5S7 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rec8Q8C5S7 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rec8Q8C5S7 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rec8Q8C5S7 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rec8Q8C5S7 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rec8Q8C5S7 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rec8Q8C5S7 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rec8Q8C5S7 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rec8Q8C5S7 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rec8Q8C5S7 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rec8Q8C5S7 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rec8Q8C5S7 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rec8Q8C5S7 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rec8Q8C5S7 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rec8Q8C5S7 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rec8Q8C5S7 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rec8Q8C5S7 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rec8Q8C5S7 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rec8Q8C5S7 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rec8Q8C5S7 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Rec8Q8C5S7 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rec8Q8C5S7 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rec8Q8C5S7 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rec8Q8C5S7 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rec8Q8C5S7 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rec8Q8C5S7 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rec8Q8C5S7 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Rec8Q8C5S7 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Rec8Q8C5S7 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Rec8Q8C5S7 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Rec8Q8C5S7 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Rec8Q8C5S7 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Rec8Q8C5S7 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Rec8Q8C5S7 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rec8Q8C5S7 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Rec8Q8C5S7 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Rec8Q8C5S7 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rec8Q8C5S7 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rec8Q8C5S7 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rec8Q8C5S7 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rec8Q8C5S7 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rec8Q8C5S7 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Rec8Q8C5S7 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rec8Q8C5S7 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rec8Q8C5S7 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rec8Q8C5S7 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rec8Q8C5S7 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rec8Q8C5S7 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rec8Q8C5S7 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rec8Q8C5S7 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rec8Q8C5S7 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rec8Q8C5S7 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rec8Q8C5S7 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rec8Q8C5S7 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rec8Q8C5S7 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms