Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc28Q80XJ3 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms