Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Actn1Q7TPR4 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Actn1Q7TPR4 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Actn1Q7TPR4 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Actn1Q7TPR4 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Actn1Q7TPR4 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Actn1Q7TPR4 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Actn1Q7TPR4 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Actn1Q7TPR4 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Actn1Q7TPR4 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Actn1Q7TPR4 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Actn1Q7TPR4 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Actn1Q7TPR4 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Actn1Q7TPR4 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Actn1Q7TPR4 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Actn1Q7TPR4 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Actn1Q7TPR4 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Actn1Q7TPR4 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Actn1Q7TPR4 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Actn1Q7TPR4 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Actn1Q7TPR4 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Actn1Q7TPR4 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Actn1Q7TPR4 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Actn1Q7TPR4 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Actn1Q7TPR4 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Actn1Q7TPR4 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Actn1Q7TPR4 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Actn1Q7TPR4 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Actn1Q7TPR4 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Actn1Q7TPR4 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Actn1Q7TPR4 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Actn1Q7TPR4 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Actn1Q7TPR4 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Actn1Q7TPR4 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Actn1Q7TPR4 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Actn1Q7TPR4 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Actn1Q7TPR4 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Actn1Q7TPR4 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Actn1Q7TPR4 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Actn1Q7TPR4 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Actn1Q7TPR4 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Actn1Q7TPR4 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Actn1Q7TPR4 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Actn1Q7TPR4 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Actn1Q7TPR4 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Actn1Q7TPR4 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Actn1Q7TPR4 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Actn1Q7TPR4 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Actn1Q7TPR4 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Actn1Q7TPR4 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Actn1Q7TPR4 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Actn1Q7TPR4 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Actn1Q7TPR4 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Actn1Q7TPR4 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Actn1Q7TPR4 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Actn1Q7TPR4 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Actn1Q7TPR4 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Actn1Q7TPR4 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Actn1Q7TPR4 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Actn1Q7TPR4 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Actn1Q7TPR4 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Actn1Q7TPR4 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Actn1Q7TPR4 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Actn1Q7TPR4 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Actn1Q7TPR4 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Actn1Q7TPR4 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Actn1Q7TPR4 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Actn1Q7TPR4 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Actn1Q7TPR4 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Actn1Q7TPR4 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Actn1Q7TPR4 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Actn1Q7TPR4 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Actn1Q7TPR4 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Actn1Q7TPR4 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Actn1Q7TPR4 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Actn1Q7TPR4 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Actn1Q7TPR4 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Actn1Q7TPR4 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Actn1Q7TPR4 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Actn1Q7TPR4 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Actn1Q7TPR4 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Actn1Q7TPR4 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Actn1Q7TPR4 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Actn1Q7TPR4 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Actn1Q7TPR4 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Actn1Q7TPR4 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Actn1Q7TPR4 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Actn1Q7TPR4 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Actn1Q7TPR4 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Actn1Q7TPR4 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Actn1Q7TPR4 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Actn1Q7TPR4 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Actn1Q7TPR4 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Actn1Q7TPR4 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Actn1Q7TPR4 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Actn1Q7TPR4 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Actn1Q7TPR4 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Actn1Q7TPR4 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Actn1Q7TPR4 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Actn1Q7TPR4 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms