Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS3

Ssx9, MCG116991, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssx9Q6XAS3 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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