Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHS6

Snx13, Sorting nexin-13, mousemouse

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Length 957 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx13Q6PHS6 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Snx13Q6PHS6 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx13Q6PHS6 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx13Q6PHS6 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx13Q6PHS6 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms