Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms