Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

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Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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