Protein–RNA interactions for Protein: Q64512

Ptpn13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, mousemouse

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Length 2,453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ptpn13Q64512 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ptpn13Q64512 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Ptpn13Q64512 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Ptpn13Q64512 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Ptpn13Q64512 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ptpn13Q64512 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ptpn13Q64512 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ptpn13Q64512 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ptpn13Q64512 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Ptpn13Q64512 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ptpn13Q64512 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ptpn13Q64512 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Ptpn13Q64512 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ptpn13Q64512 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ptpn13Q64512 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ptpn13Q64512 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ptpn13Q64512 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ptpn13Q64512 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms