Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
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Ccdc18Q640L5 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc18Q640L5 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc18Q640L5 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc18Q640L5 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
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Ccdc18Q640L5 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
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Ccdc18Q640L5 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
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Ccdc18Q640L5 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc18Q640L5 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc18Q640L5 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc18Q640L5 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc18Q640L5 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc18Q640L5 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc18Q640L5 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc18Q640L5 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc18Q640L5 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc18Q640L5 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
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Ccdc18Q640L5 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Ccdc18Q640L5 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
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Ccdc18Q640L5 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc18Q640L5 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc18Q640L5 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc18Q640L5 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
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