Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mkrn3Q60764 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mkrn3Q60764 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mkrn3Q60764 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mkrn3Q60764 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mkrn3Q60764 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mkrn3Q60764 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mkrn3Q60764 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mkrn3Q60764 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mkrn3Q60764 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Mkrn3Q60764 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mkrn3Q60764 Vmn1r185-201ENSMUST00000171039 1144 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mkrn3Q60764 Milr1-207ENSMUST00000182908 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mkrn3Q60764 Gm37751-201ENSMUST00000192440 1198 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Mkrn3Q60764 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Mkrn3Q60764 Gm37215-201ENSMUST00000194927 1259 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Mkrn3Q60764 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Mkrn3Q60764 5430434I15Rik-201ENSMUST00000197658 1257 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mkrn3Q60764 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mkrn3Q60764 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Mkrn3Q60764 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mkrn3Q60764 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mkrn3Q60764 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mkrn3Q60764 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mkrn3Q60764 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mkrn3Q60764 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mkrn3Q60764 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mkrn3Q60764 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mkrn3Q60764 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mkrn3Q60764 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mkrn3Q60764 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mkrn3Q60764 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mkrn3Q60764 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mkrn3Q60764 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mkrn3Q60764 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mkrn3Q60764 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mkrn3Q60764 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Mkrn3Q60764 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Mkrn3Q60764 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Mkrn3Q60764 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Mkrn3Q60764 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Mkrn3Q60764 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Mkrn3Q60764 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Mkrn3Q60764 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Mkrn3Q60764 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Mkrn3Q60764 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Mkrn3Q60764 Tcstv1-201ENSMUST00000178510 1280 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Mkrn3Q60764 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Mkrn3Q60764 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Mkrn3Q60764 Olfr570-202ENSMUST00000209778 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Mkrn3Q60764 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Mkrn3Q60764 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Mkrn3Q60764 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Mkrn3Q60764 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Mkrn3Q60764 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Mkrn3Q60764 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Mkrn3Q60764 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Mkrn3Q60764 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Mkrn3Q60764 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Mkrn3Q60764 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Gm28438-201ENSMUST00000188299 345 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Trbv27-201ENSMUST00000193711 277 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Olfr1473-ps1-201ENSMUST00000207135 958 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Gm36287-201ENSMUST00000223481 796 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms