Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc3lQ4KL14 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc3lQ4KL14 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc3lQ4KL14 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc3lQ4KL14 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc3lQ4KL14 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc3lQ4KL14 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trappc3lQ4KL14 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trappc3lQ4KL14 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trappc3lQ4KL14 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Trappc3lQ4KL14 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trappc3lQ4KL14 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trappc3lQ4KL14 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trappc3lQ4KL14 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trappc3lQ4KL14 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trappc3lQ4KL14 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trappc3lQ4KL14 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Trappc3lQ4KL14 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trappc3lQ4KL14 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trappc3lQ4KL14 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms