Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp48Q3V0C5 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp48Q3V0C5 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp48Q3V0C5 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp48Q3V0C5 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp48Q3V0C5 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp48Q3V0C5 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp48Q3V0C5 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp48Q3V0C5 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp48Q3V0C5 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp48Q3V0C5 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp48Q3V0C5 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp48Q3V0C5 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp48Q3V0C5 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp48Q3V0C5 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp48Q3V0C5 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp48Q3V0C5 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp48Q3V0C5 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp48Q3V0C5 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp48Q3V0C5 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp48Q3V0C5 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp48Q3V0C5 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp48Q3V0C5 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp48Q3V0C5 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp48Q3V0C5 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp48Q3V0C5 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp48Q3V0C5 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp48Q3V0C5 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp48Q3V0C5 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp48Q3V0C5 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp48Q3V0C5 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp48Q3V0C5 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp48Q3V0C5 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp48Q3V0C5 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp48Q3V0C5 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp48Q3V0C5 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp48Q3V0C5 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp48Q3V0C5 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp48Q3V0C5 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp48Q3V0C5 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp48Q3V0C5 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp48Q3V0C5 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp48Q3V0C5 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp48Q3V0C5 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp48Q3V0C5 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Usp48Q3V0C5 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Usp48Q3V0C5 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Usp48Q3V0C5 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Usp48Q3V0C5 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Usp48Q3V0C5 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Usp48Q3V0C5 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp48Q3V0C5 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp48Q3V0C5 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp48Q3V0C5 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp48Q3V0C5 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp48Q3V0C5 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp48Q3V0C5 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp48Q3V0C5 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp48Q3V0C5 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp48Q3V0C5 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp48Q3V0C5 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp48Q3V0C5 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp48Q3V0C5 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp48Q3V0C5 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp48Q3V0C5 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp48Q3V0C5 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp48Q3V0C5 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp48Q3V0C5 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp48Q3V0C5 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp48Q3V0C5 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp48Q3V0C5 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp48Q3V0C5 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp48Q3V0C5 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp48Q3V0C5 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp48Q3V0C5 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp48Q3V0C5 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp48Q3V0C5 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp48Q3V0C5 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp48Q3V0C5 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp48Q3V0C5 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp48Q3V0C5 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp48Q3V0C5 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp48Q3V0C5 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp48Q3V0C5 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp48Q3V0C5 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp48Q3V0C5 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp48Q3V0C5 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp48Q3V0C5 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp48Q3V0C5 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp48Q3V0C5 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp48Q3V0C5 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp48Q3V0C5 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp48Q3V0C5 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp48Q3V0C5 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp48Q3V0C5 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp48Q3V0C5 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp48Q3V0C5 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp48Q3V0C5 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp48Q3V0C5 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp48Q3V0C5 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms