Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR9

Sbspon, Somatomedin-B and thrombospondin type-1 domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsponQ3UPR9 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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