Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
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Rnf180Q3U827 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf180Q3U827 Gm26989-201ENSMUST00000182608 749 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf180Q3U827 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf180Q3U827 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf180Q3U827 Prrg2-211ENSMUST00000211337 676 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf180Q3U827 AC134537.1-201ENSMUST00000219205 265 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf180Q3U827 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
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Rnf180Q3U827 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf180Q3U827 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf180Q3U827 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf180Q3U827 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf180Q3U827 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf180Q3U827 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf180Q3U827 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf180Q3U827 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf180Q3U827 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf180Q3U827 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf180Q3U827 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf180Q3U827 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf180Q3U827 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf180Q3U827 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf180Q3U827 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf180Q3U827 Mrpl24-204ENSMUST00000121920 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf180Q3U827 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf180Q3U827 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf180Q3U827 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf180Q3U827 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Rnf180Q3U827 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf180Q3U827 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf180Q3U827 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Rnf180Q3U827 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf180Q3U827 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Rnf180Q3U827 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Rnf180Q3U827 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf180Q3U827 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf180Q3U827 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Rnf180Q3U827 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf180Q3U827 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf180Q3U827 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf180Q3U827 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf180Q3U827 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf180Q3U827 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf180Q3U827 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf180Q3U827 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf180Q3U827 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf180Q3U827 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf180Q3U827 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf180Q3U827 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf180Q3U827 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf180Q3U827 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf180Q3U827 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf180Q3U827 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf180Q3U827 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf180Q3U827 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf180Q3U827 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf180Q3U827 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf180Q3U827 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf180Q3U827 Fxyd5-209ENSMUST00000162087 762 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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