Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp39Q3TIX9 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp39Q3TIX9 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp39Q3TIX9 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp39Q3TIX9 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp39Q3TIX9 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp39Q3TIX9 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp39Q3TIX9 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Usp39Q3TIX9 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp39Q3TIX9 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp39Q3TIX9 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
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Usp39Q3TIX9 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Usp39Q3TIX9 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
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Usp39Q3TIX9 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
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Usp39Q3TIX9 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp39Q3TIX9 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp39Q3TIX9 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Usp39Q3TIX9 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Usp39Q3TIX9 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp39Q3TIX9 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Usp39Q3TIX9 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp39Q3TIX9 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp39Q3TIX9 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp39Q3TIX9 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp39Q3TIX9 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp39Q3TIX9 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp39Q3TIX9 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp39Q3TIX9 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp39Q3TIX9 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp39Q3TIX9 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp39Q3TIX9 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp39Q3TIX9 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp39Q3TIX9 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp39Q3TIX9 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp39Q3TIX9 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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