Protein–RNA interactions for Protein: Q24JP3

Fam178b, Protein FAM178B, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam178bQ24JP3 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Fam178bQ24JP3 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Fam178bQ24JP3 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Fam178bQ24JP3 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Fam178bQ24JP3 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Fam178bQ24JP3 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Fam178bQ24JP3 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Fam178bQ24JP3 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Fam178bQ24JP3 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Fam178bQ24JP3 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Fam178bQ24JP3 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Fam178bQ24JP3 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam178bQ24JP3 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam178bQ24JP3 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam178bQ24JP3 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam178bQ24JP3 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam178bQ24JP3 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam178bQ24JP3 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam178bQ24JP3 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam178bQ24JP3 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam178bQ24JP3 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam178bQ24JP3 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms