Protein–RNA interactions for Protein: Q149B8

Perm1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, mousemouse

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Length 807 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Perm1Q149B8 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Perm1Q149B8 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Perm1Q149B8 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Perm1Q149B8 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Perm1Q149B8 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Perm1Q149B8 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Perm1Q149B8 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Perm1Q149B8 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Perm1Q149B8 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Perm1Q149B8 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Perm1Q149B8 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Perm1Q149B8 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Perm1Q149B8 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Perm1Q149B8 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Perm1Q149B8 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Perm1Q149B8 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Perm1Q149B8 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Perm1Q149B8 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Perm1Q149B8 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Perm1Q149B8 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Perm1Q149B8 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Perm1Q149B8 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Perm1Q149B8 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Perm1Q149B8 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Perm1Q149B8 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Perm1Q149B8 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Perm1Q149B8 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Perm1Q149B8 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Perm1Q149B8 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Perm1Q149B8 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Perm1Q149B8 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Perm1Q149B8 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Perm1Q149B8 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Perm1Q149B8 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Perm1Q149B8 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Perm1Q149B8 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
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Perm1Q149B8 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Perm1Q149B8 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Perm1Q149B8 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Perm1Q149B8 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Perm1Q149B8 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Perm1Q149B8 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Perm1Q149B8 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Perm1Q149B8 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Perm1Q149B8 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Perm1Q149B8 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Perm1Q149B8 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Perm1Q149B8 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Perm1Q149B8 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Perm1Q149B8 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Perm1Q149B8 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Perm1Q149B8 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Perm1Q149B8 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Perm1Q149B8 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Perm1Q149B8 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Perm1Q149B8 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Perm1Q149B8 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Perm1Q149B8 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Perm1Q149B8 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Perm1Q149B8 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Perm1Q149B8 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Perm1Q149B8 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms