Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ttc39dQ0VF76 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ttc39dQ0VF76 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ttc39dQ0VF76 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ttc39dQ0VF76 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ttc39dQ0VF76 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Ttc39dQ0VF76 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ttc39dQ0VF76 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ttc39dQ0VF76 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ttc39dQ0VF76 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Ttc39dQ0VF76 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Ttc39dQ0VF76 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
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Ttc39dQ0VF76 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ttc39dQ0VF76 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ttc39dQ0VF76 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Ttc39dQ0VF76 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Ttc39dQ0VF76 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ttc39dQ0VF76 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ttc39dQ0VF76 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ttc39dQ0VF76 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ttc39dQ0VF76 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Ttc39dQ0VF76 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Ttc39dQ0VF76 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ttc39dQ0VF76 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Ttc39dQ0VF76 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Ttc39dQ0VF76 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ttc39dQ0VF76 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ttc39dQ0VF76 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ttc39dQ0VF76 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Ttc39dQ0VF76 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ttc39dQ0VF76 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ttc39dQ0VF76 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ttc39dQ0VF76 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ttc39dQ0VF76 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ttc39dQ0VF76 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ttc39dQ0VF76 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ttc39dQ0VF76 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ttc39dQ0VF76 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ttc39dQ0VF76 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ttc39dQ0VF76 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ttc39dQ0VF76 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ttc39dQ0VF76 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ttc39dQ0VF76 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ttc39dQ0VF76 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ttc39dQ0VF76 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ttc39dQ0VF76 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ttc39dQ0VF76 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ttc39dQ0VF76 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ttc39dQ0VF76 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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