Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms