Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms