Protein–RNA interactions for Protein: Q03366

Ccl7, C-C motif chemokine 7, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl7Q03366 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl7Q03366 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl7Q03366 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl7Q03366 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl7Q03366 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl7Q03366 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl7Q03366 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl7Q03366 Gm5860-202ENSMUST00000151038 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl7Q03366 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl7Q03366 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl7Q03366 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl7Q03366 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl7Q03366 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl7Q03366 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl7Q03366 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl7Q03366 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl7Q03366 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl7Q03366 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl7Q03366 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl7Q03366 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl7Q03366 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl7Q03366 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl7Q03366 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl7Q03366 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl7Q03366 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl7Q03366 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl7Q03366 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl7Q03366 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl7Q03366 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl7Q03366 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl7Q03366 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl7Q03366 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl7Q03366 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl7Q03366 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl7Q03366 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl7Q03366 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl7Q03366 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl7Q03366 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl7Q03366 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl7Q03366 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl7Q03366 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl7Q03366 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl7Q03366 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl7Q03366 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl7Q03366 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl7Q03366 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl7Q03366 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl7Q03366 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl7Q03366 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl7Q03366 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl7Q03366 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl7Q03366 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl7Q03366 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl7Q03366 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl7Q03366 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl7Q03366 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl7Q03366 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl7Q03366 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl7Q03366 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl7Q03366 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl7Q03366 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl7Q03366 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl7Q03366 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl7Q03366 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl7Q03366 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl7Q03366 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl7Q03366 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl7Q03366 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl7Q03366 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl7Q03366 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl7Q03366 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccl7Q03366 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccl7Q03366 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccl7Q03366 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccl7Q03366 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccl7Q03366 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccl7Q03366 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccl7Q03366 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccl7Q03366 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccl7Q03366 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccl7Q03366 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccl7Q03366 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccl7Q03366 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccl7Q03366 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccl7Q03366 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccl7Q03366 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccl7Q03366 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccl7Q03366 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccl7Q03366 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccl7Q03366 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccl7Q03366 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccl7Q03366 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccl7Q03366 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccl7Q03366 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccl7Q03366 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccl7Q03366 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccl7Q03366 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccl7Q03366 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccl7Q03366 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccl7Q03366 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms