Protein–RNA interactions for Protein: Q02739

Gjb5, Gap junction beta-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb5Q02739 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68 ms