Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gja5Q01231 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gja5Q01231 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gja5Q01231 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gja5Q01231 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gja5Q01231 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gja5Q01231 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gja5Q01231 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gja5Q01231 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gja5Q01231 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gja5Q01231 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gja5Q01231 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gja5Q01231 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gja5Q01231 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gja5Q01231 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gja5Q01231 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gja5Q01231 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gja5Q01231 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gja5Q01231 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gja5Q01231 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gja5Q01231 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gja5Q01231 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gja5Q01231 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gja5Q01231 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gja5Q01231 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gja5Q01231 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gja5Q01231 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gja5Q01231 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gja5Q01231 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gja5Q01231 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gja5Q01231 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gja5Q01231 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gja5Q01231 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gja5Q01231 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gja5Q01231 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gja5Q01231 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gja5Q01231 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gja5Q01231 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gja5Q01231 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gja5Q01231 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gja5Q01231 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gja5Q01231 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gja5Q01231 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gja5Q01231 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gja5Q01231 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gja5Q01231 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gja5Q01231 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gja5Q01231 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gja5Q01231 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gja5Q01231 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gja5Q01231 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gja5Q01231 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gja5Q01231 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gja5Q01231 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gja5Q01231 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gja5Q01231 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gja5Q01231 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gja5Q01231 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gja5Q01231 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gja5Q01231 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gja5Q01231 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gja5Q01231 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gja5Q01231 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gja5Q01231 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gja5Q01231 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gja5Q01231 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gja5Q01231 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gja5Q01231 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gja5Q01231 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gja5Q01231 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gja5Q01231 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gja5Q01231 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gja5Q01231 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gja5Q01231 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gja5Q01231 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gja5Q01231 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gja5Q01231 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gja5Q01231 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gja5Q01231 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gja5Q01231 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gja5Q01231 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gja5Q01231 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gja5Q01231 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gja5Q01231 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gja5Q01231 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gja5Q01231 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gja5Q01231 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gja5Q01231 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gja5Q01231 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gja5Q01231 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gja5Q01231 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gja5Q01231 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gja5Q01231 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gja5Q01231 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gja5Q01231 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gja5Q01231 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gja5Q01231 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gja5Q01231 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gja5Q01231 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gja5Q01231 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms