Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irx3P81067 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irx3P81067 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Irx3P81067 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Irx3P81067 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Irx3P81067 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irx3P81067 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irx3P81067 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms