Protein–RNA interactions for Protein: P70662

Ldb1, LIM domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb1P70662 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
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