Protein–RNA interactions for Protein: P70340

Smad1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad1P70340 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smad1P70340 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smad1P70340 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smad1P70340 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Smad1P70340 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smad1P70340 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smad1P70340 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smad1P70340 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smad1P70340 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smad1P70340 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smad1P70340 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smad1P70340 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Smad1P70340 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smad1P70340 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smad1P70340 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smad1P70340 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smad1P70340 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smad1P70340 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smad1P70340 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smad1P70340 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smad1P70340 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smad1P70340 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smad1P70340 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smad1P70340 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smad1P70340 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smad1P70340 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smad1P70340 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smad1P70340 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smad1P70340 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smad1P70340 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Smad1P70340 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smad1P70340 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Smad1P70340 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smad1P70340 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Smad1P70340 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smad1P70340 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smad1P70340 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smad1P70340 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smad1P70340 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smad1P70340 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smad1P70340 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smad1P70340 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smad1P70340 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smad1P70340 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smad1P70340 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smad1P70340 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smad1P70340 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smad1P70340 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smad1P70340 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smad1P70340 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smad1P70340 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smad1P70340 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smad1P70340 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smad1P70340 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smad1P70340 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smad1P70340 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smad1P70340 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smad1P70340 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Smad1P70340 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smad1P70340 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smad1P70340 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smad1P70340 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smad1P70340 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smad1P70340 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smad1P70340 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Smad1P70340 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smad1P70340 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smad1P70340 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Smad1P70340 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smad1P70340 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smad1P70340 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smad1P70340 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Smad1P70340 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smad1P70340 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smad1P70340 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smad1P70340 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smad1P70340 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smad1P70340 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smad1P70340 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smad1P70340 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smad1P70340 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smad1P70340 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smad1P70340 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smad1P70340 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Smad1P70340 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smad1P70340 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smad1P70340 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smad1P70340 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smad1P70340 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smad1P70340 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smad1P70340 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smad1P70340 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Smad1P70340 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smad1P70340 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smad1P70340 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smad1P70340 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smad1P70340 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smad1P70340 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smad1P70340 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smad1P70340 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms