Protein–RNA interactions for Protein: P62858

Rps28, 40S ribosomal protein S28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps28P62858 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rps28P62858 4930505M18Rik-201ENSMUST00000175854 1288 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rps28P62858 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Dhx40-201ENSMUST00000018569 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rps28P62858 AC125070.1-201ENSMUST00000223523 555 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rps28P62858 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Gm45635-201ENSMUST00000211516 2134 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rps28P62858 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rps28P62858 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Il10ra-202ENSMUST00000176222 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Fes-201ENSMUST00000080932 2762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Gm1627-201ENSMUST00000188504 2588 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Tdp1-207ENSMUST00000153627 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Speer4b-201ENSMUST00000053257 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rps28P62858 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rps28P62858 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rps28P62858 2810029C07Rik-201ENSMUST00000180698 1954 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rps28P62858 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Spag6l-201ENSMUST00000023468 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Wfdc8-202ENSMUST00000109338 1794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Apol11b-204ENSMUST00000181467 1933 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Pask-201ENSMUST00000027493 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Zbtb25-202ENSMUST00000176102 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Rerg-201ENSMUST00000032347 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Ipo7-201ENSMUST00000084731 4763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Sec22c-201ENSMUST00000078547 5713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Fcamr-201ENSMUST00000027670 1743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Gm44531-201ENSMUST00000208364 2000 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rps28P62858 4933427D06Rik-204ENSMUST00000168837 2467 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rps28P62858 R3hdm2-201ENSMUST00000064793 4175 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Gm7340-201ENSMUST00000119729 2752 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
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