Protein–RNA interactions for Protein: P60335

Pcbp1, Poly(rC)-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp1P60335 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pcbp1P60335 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pcbp1P60335 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pcbp1P60335 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pcbp1P60335 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pcbp1P60335 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pcbp1P60335 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pcbp1P60335 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pcbp1P60335 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pcbp1P60335 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pcbp1P60335 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pcbp1P60335 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pcbp1P60335 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pcbp1P60335 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pcbp1P60335 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pcbp1P60335 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pcbp1P60335 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pcbp1P60335 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pcbp1P60335 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Pcbp1P60335 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Pcbp1P60335 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pcbp1P60335 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pcbp1P60335 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pcbp1P60335 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pcbp1P60335 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pcbp1P60335 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pcbp1P60335 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pcbp1P60335 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Pcbp1P60335 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Pcbp1P60335 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Pcbp1P60335 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pcbp1P60335 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pcbp1P60335 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pcbp1P60335 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pcbp1P60335 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pcbp1P60335 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pcbp1P60335 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Pcbp1P60335 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pcbp1P60335 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Pcbp1P60335 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pcbp1P60335 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pcbp1P60335 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pcbp1P60335 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pcbp1P60335 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pcbp1P60335 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pcbp1P60335 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pcbp1P60335 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pcbp1P60335 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pcbp1P60335 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pcbp1P60335 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pcbp1P60335 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pcbp1P60335 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pcbp1P60335 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pcbp1P60335 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pcbp1P60335 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pcbp1P60335 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Pcbp1P60335 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pcbp1P60335 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pcbp1P60335 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pcbp1P60335 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pcbp1P60335 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Pcbp1P60335 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pcbp1P60335 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pcbp1P60335 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pcbp1P60335 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pcbp1P60335 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Pcbp1P60335 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Pcbp1P60335 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Pcbp1P60335 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pcbp1P60335 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Pcbp1P60335 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Pcbp1P60335 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pcbp1P60335 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pcbp1P60335 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pcbp1P60335 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pcbp1P60335 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pcbp1P60335 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pcbp1P60335 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pcbp1P60335 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pcbp1P60335 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pcbp1P60335 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pcbp1P60335 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pcbp1P60335 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pcbp1P60335 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pcbp1P60335 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pcbp1P60335 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pcbp1P60335 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pcbp1P60335 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pcbp1P60335 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pcbp1P60335 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pcbp1P60335 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pcbp1P60335 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pcbp1P60335 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pcbp1P60335 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pcbp1P60335 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pcbp1P60335 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pcbp1P60335 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pcbp1P60335 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pcbp1P60335 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pcbp1P60335 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms