Protein–RNA interactions for Protein: P59055

Csrnp3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp3P59055 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Csrnp3P59055 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Csrnp3P59055 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Csrnp3P59055 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Csrnp3P59055 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Csrnp3P59055 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Csrnp3P59055 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Csrnp3P59055 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Csrnp3P59055 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Csrnp3P59055 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Csrnp3P59055 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Csrnp3P59055 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Csrnp3P59055 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Csrnp3P59055 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Csrnp3P59055 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Csrnp3P59055 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Csrnp3P59055 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Csrnp3P59055 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Csrnp3P59055 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Csrnp3P59055 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Csrnp3P59055 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Csrnp3P59055 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Csrnp3P59055 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Csrnp3P59055 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Csrnp3P59055 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Csrnp3P59055 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Csrnp3P59055 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Csrnp3P59055 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Csrnp3P59055 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Csrnp3P59055 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Csrnp3P59055 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Csrnp3P59055 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Csrnp3P59055 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Csrnp3P59055 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms