Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp5P56399 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp5P56399 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp5P56399 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp5P56399 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp5P56399 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp5P56399 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp5P56399 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp5P56399 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.3 ms