Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Zfp957-201ENSMUST00000040802 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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