Protein–RNA interactions for Protein: P52955

Lbx1, Transcription factor LBX1, mousemouse

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Length 282 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lbx1P52955 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Lbx1P52955 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lbx1P52955 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lbx1P52955 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lbx1P52955 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lbx1P52955 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lbx1P52955 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lbx1P52955 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Lbx1P52955 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Lbx1P52955 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Lbx1P52955 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Lbx1P52955 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Lbx1P52955 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Lbx1P52955 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Lbx1P52955 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Lbx1P52955 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Lbx1P52955 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Lbx1P52955 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lbx1P52955 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lbx1P52955 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lbx1P52955 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lbx1P52955 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lbx1P52955 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lbx1P52955 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lbx1P52955 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lbx1P52955 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lbx1P52955 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lbx1P52955 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lbx1P52955 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lbx1P52955 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lbx1P52955 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lbx1P52955 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lbx1P52955 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lbx1P52955 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lbx1P52955 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lbx1P52955 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lbx1P52955 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lbx1P52955 Surf6-202ENSMUST00000114043 894 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lbx1P52955 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Lbx1P52955 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Lbx1P52955 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lbx1P52955 Gm4862-201ENSMUST00000170405 438 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Lbx1P52955 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lbx1P52955 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lbx1P52955 1810026B05Rik-208ENSMUST00000190028 590 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lbx1P52955 Zfp655-203ENSMUST00000196069 1150 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lbx1P52955 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Lbx1P52955 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lbx1P52955 Acy1-211ENSMUST00000216400 1030 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lbx1P52955 Pbld1-206ENSMUST00000219687 788 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lbx1P52955 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Lbx1P52955 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lbx1P52955 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lbx1P52955 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lbx1P52955 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lbx1P52955 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lbx1P52955 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lbx1P52955 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lbx1P52955 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Lbx1P52955 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lbx1P52955 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lbx1P52955 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lbx1P52955 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lbx1P52955 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lbx1P52955 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lbx1P52955 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lbx1P52955 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lbx1P52955 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lbx1P52955 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lbx1P52955 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lbx1P52955 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lbx1P52955 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lbx1P52955 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lbx1P52955 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lbx1P52955 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lbx1P52955 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lbx1P52955 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lbx1P52955 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lbx1P52955 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lbx1P52955 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lbx1P52955 Mir181d-201ENSMUST00000102383 72 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Lbx1P52955 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lbx1P52955 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lbx1P52955 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lbx1P52955 1700088E04Rik-210ENSMUST00000190509 871 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lbx1P52955 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Lbx1P52955 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Lbx1P52955 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lbx1P52955 Ighv1-86-201ENSMUST00000200562 353 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Lbx1P52955 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lbx1P52955 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lbx1P52955 Gm44953-201ENSMUST00000208745 1286 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Lbx1P52955 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Lbx1P52955 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lbx1P52955 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lbx1P52955 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lbx1P52955 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lbx1P52955 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lbx1P52955 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lbx1P52955 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
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