Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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