Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
FmodP50608 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
FmodP50608 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
FmodP50608 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
FmodP50608 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
FmodP50608 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
FmodP50608 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
FmodP50608 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
FmodP50608 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
FmodP50608 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
FmodP50608 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
FmodP50608 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
FmodP50608 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
FmodP50608 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
FmodP50608 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
FmodP50608 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
FmodP50608 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
FmodP50608 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
FmodP50608 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
FmodP50608 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
FmodP50608 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
FmodP50608 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
FmodP50608 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
FmodP50608 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
FmodP50608 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
FmodP50608 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
FmodP50608 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
FmodP50608 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
FmodP50608 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
FmodP50608 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
FmodP50608 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
FmodP50608 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
FmodP50608 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
FmodP50608 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
FmodP50608 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
FmodP50608 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
FmodP50608 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
FmodP50608 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
FmodP50608 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
FmodP50608 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
FmodP50608 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
FmodP50608 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
FmodP50608 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
FmodP50608 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
FmodP50608 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
FmodP50608 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
FmodP50608 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
FmodP50608 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
FmodP50608 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
FmodP50608 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
FmodP50608 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
FmodP50608 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
FmodP50608 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
FmodP50608 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
FmodP50608 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
FmodP50608 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
FmodP50608 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
FmodP50608 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
FmodP50608 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
FmodP50608 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
FmodP50608 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
FmodP50608 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
FmodP50608 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
FmodP50608 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
FmodP50608 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
FmodP50608 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
FmodP50608 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
FmodP50608 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
FmodP50608 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
FmodP50608 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
FmodP50608 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
FmodP50608 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
FmodP50608 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
FmodP50608 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
FmodP50608 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
FmodP50608 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
FmodP50608 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
FmodP50608 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
FmodP50608 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
FmodP50608 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
FmodP50608 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
FmodP50608 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
FmodP50608 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
FmodP50608 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
FmodP50608 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
FmodP50608 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
FmodP50608 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
FmodP50608 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
FmodP50608 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
FmodP50608 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
FmodP50608 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
FmodP50608 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
FmodP50608 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
FmodP50608 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
FmodP50608 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
FmodP50608 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
FmodP50608 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
FmodP50608 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
FmodP50608 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
FmodP50608 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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