Protein–RNA interactions for Protein: P49935

Ctsh, Pro-cathepsin H, mousemouse

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Length 333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtshP49935 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CtshP49935 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CtshP49935 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CtshP49935 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CtshP49935 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CtshP49935 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CtshP49935 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CtshP49935 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CtshP49935 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CtshP49935 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CtshP49935 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CtshP49935 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CtshP49935 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CtshP49935 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CtshP49935 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CtshP49935 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CtshP49935 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CtshP49935 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CtshP49935 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CtshP49935 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CtshP49935 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CtshP49935 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
CtshP49935 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CtshP49935 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CtshP49935 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CtshP49935 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CtshP49935 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CtshP49935 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CtshP49935 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CtshP49935 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CtshP49935 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CtshP49935 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CtshP49935 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CtshP49935 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CtshP49935 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CtshP49935 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CtshP49935 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CtshP49935 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CtshP49935 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CtshP49935 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CtshP49935 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CtshP49935 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CtshP49935 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CtshP49935 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CtshP49935 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CtshP49935 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CtshP49935 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CtshP49935 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CtshP49935 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CtshP49935 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CtshP49935 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CtshP49935 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CtshP49935 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CtshP49935 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CtshP49935 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CtshP49935 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CtshP49935 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CtshP49935 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CtshP49935 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CtshP49935 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CtshP49935 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CtshP49935 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CtshP49935 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CtshP49935 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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CtshP49935 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
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CtshP49935 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CtshP49935 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CtshP49935 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CtshP49935 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CtshP49935 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CtshP49935 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CtshP49935 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CtshP49935 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CtshP49935 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CtshP49935 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CtshP49935 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CtshP49935 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CtshP49935 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CtshP49935 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CtshP49935 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CtshP49935 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CtshP49935 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CtshP49935 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CtshP49935 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CtshP49935 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CtshP49935 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CtshP49935 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CtshP49935 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CtshP49935 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CtshP49935 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CtshP49935 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CtshP49935 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CtshP49935 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CtshP49935 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CtshP49935 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CtshP49935 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CtshP49935 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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