Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PtpreP49446 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PtpreP49446 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PtpreP49446 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PtpreP49446 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PtpreP49446 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PtpreP49446 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PtpreP49446 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PtpreP49446 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PtpreP49446 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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PtpreP49446 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PtpreP49446 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PtpreP49446 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PtpreP49446 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PtpreP49446 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PtpreP49446 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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PtpreP49446 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PtpreP49446 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PtpreP49446 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PtpreP49446 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PtpreP49446 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PtpreP49446 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PtpreP49446 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PtpreP49446 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PtpreP49446 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
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PtpreP49446 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PtpreP49446 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PtpreP49446 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PtpreP49446 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PtpreP49446 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PtpreP49446 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PtpreP49446 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PtpreP49446 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PtpreP49446 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PtpreP49446 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PtpreP49446 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PtpreP49446 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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PtpreP49446 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PtpreP49446 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PtpreP49446 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PtpreP49446 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PtpreP49446 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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PtpreP49446 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PtpreP49446 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
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PtpreP49446 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PtpreP49446 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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PtpreP49446 Prr9-201ENSMUST00000070284 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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PtpreP49446 Cd59a-201ENSMUST00000040423 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PtpreP49446 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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PtpreP49446 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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PtpreP49446 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtpreP49446 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Olfr1460-ps1-201ENSMUST00000208975 899 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
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