Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VdrP48281 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VdrP48281 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VdrP48281 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VdrP48281 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
VdrP48281 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VdrP48281 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VdrP48281 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VdrP48281 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VdrP48281 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VdrP48281 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
VdrP48281 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
VdrP48281 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
VdrP48281 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
VdrP48281 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
VdrP48281 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VdrP48281 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VdrP48281 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VdrP48281 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
VdrP48281 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VdrP48281 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
VdrP48281 Gm20052-201ENSMUST00000200831 1525 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VdrP48281 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
VdrP48281 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
VdrP48281 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VdrP48281 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
VdrP48281 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
VdrP48281 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VdrP48281 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
VdrP48281 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
VdrP48281 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VdrP48281 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
VdrP48281 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
VdrP48281 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VdrP48281 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
VdrP48281 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VdrP48281 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VdrP48281 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VdrP48281 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
VdrP48281 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
VdrP48281 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VdrP48281 Msantd2-204ENSMUST00000211060 2165 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
VdrP48281 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VdrP48281 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VdrP48281 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VdrP48281 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VdrP48281 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VdrP48281 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VdrP48281 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VdrP48281 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VdrP48281 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
VdrP48281 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VdrP48281 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VdrP48281 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VdrP48281 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VdrP48281 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VdrP48281 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VdrP48281 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VdrP48281 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VdrP48281 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VdrP48281 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VdrP48281 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VdrP48281 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VdrP48281 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VdrP48281 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
VdrP48281 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
VdrP48281 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VdrP48281 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VdrP48281 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VdrP48281 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VdrP48281 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VdrP48281 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VdrP48281 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VdrP48281 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
VdrP48281 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VdrP48281 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VdrP48281 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VdrP48281 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VdrP48281 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VdrP48281 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VdrP48281 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VdrP48281 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
VdrP48281 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
VdrP48281 4930518I15Rik-201ENSMUST00000099141 1331 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
VdrP48281 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VdrP48281 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VdrP48281 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VdrP48281 Nrf1-206ENSMUST00000115204 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VdrP48281 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VdrP48281 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VdrP48281 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
VdrP48281 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VdrP48281 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
VdrP48281 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
VdrP48281 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VdrP48281 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
VdrP48281 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
VdrP48281 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
VdrP48281 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
VdrP48281 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms