Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms