Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LtbP41155 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LtbP41155 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LtbP41155 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LtbP41155 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LtbP41155 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LtbP41155 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LtbP41155 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LtbP41155 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LtbP41155 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LtbP41155 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LtbP41155 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LtbP41155 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LtbP41155 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
LtbP41155 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
LtbP41155 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LtbP41155 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
LtbP41155 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
LtbP41155 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
LtbP41155 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LtbP41155 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
LtbP41155 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LtbP41155 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LtbP41155 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LtbP41155 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LtbP41155 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LtbP41155 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LtbP41155 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LtbP41155 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LtbP41155 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LtbP41155 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LtbP41155 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LtbP41155 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LtbP41155 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LtbP41155 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LtbP41155 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LtbP41155 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LtbP41155 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LtbP41155 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LtbP41155 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LtbP41155 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LtbP41155 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LtbP41155 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LtbP41155 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LtbP41155 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LtbP41155 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LtbP41155 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
LtbP41155 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LtbP41155 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LtbP41155 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LtbP41155 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LtbP41155 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LtbP41155 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LtbP41155 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LtbP41155 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LtbP41155 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
LtbP41155 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LtbP41155 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LtbP41155 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LtbP41155 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LtbP41155 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LtbP41155 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LtbP41155 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LtbP41155 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LtbP41155 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
LtbP41155 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
LtbP41155 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LtbP41155 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
LtbP41155 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
LtbP41155 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
LtbP41155 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LtbP41155 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
LtbP41155 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LtbP41155 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LtbP41155 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LtbP41155 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LtbP41155 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LtbP41155 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LtbP41155 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LtbP41155 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LtbP41155 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LtbP41155 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LtbP41155 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LtbP41155 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LtbP41155 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LtbP41155 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LtbP41155 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LtbP41155 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LtbP41155 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LtbP41155 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LtbP41155 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LtbP41155 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LtbP41155 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LtbP41155 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LtbP41155 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LtbP41155 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LtbP41155 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LtbP41155 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
LtbP41155 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LtbP41155 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms