Protein–RNA interactions for Protein: P28867

Prkcd, Protein kinase C delta type, mousemouse

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Length 674 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcdP28867 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
PrkcdP28867 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PrkcdP28867 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PrkcdP28867 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PrkcdP28867 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PrkcdP28867 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PrkcdP28867 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PrkcdP28867 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PrkcdP28867 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
PrkcdP28867 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PrkcdP28867 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PrkcdP28867 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PrkcdP28867 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PrkcdP28867 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PrkcdP28867 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PrkcdP28867 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PrkcdP28867 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PrkcdP28867 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PrkcdP28867 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
PrkcdP28867 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PrkcdP28867 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PrkcdP28867 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PrkcdP28867 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PrkcdP28867 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PrkcdP28867 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PrkcdP28867 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PrkcdP28867 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PrkcdP28867 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PrkcdP28867 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PrkcdP28867 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PrkcdP28867 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrkcdP28867 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrkcdP28867 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrkcdP28867 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrkcdP28867 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrkcdP28867 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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