Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms